岷山深处的生态秘境
黑水县位于四川省阿坝藏族羌族自治州中部，东南与茂县连接，西南与理县毗邻，西与红原县相连，东北与松潘县接壤，介于东经102°35′~103°30′，北纬31°35′~32°38′之间，县域面积4356平方千米。
黑水县西、北两面山原地貌地形切割缓慢，地质较平缓，东、南两面和中部为高山峡谷地貌，沟谷与山脊并列。最高点奥太基山峰海拔5286米，最低点色尔古河坝海拔1790米，平均海拔3544米，高差1000~2000米。
黑水县境内有黑水河、大黑水河、小黑水河、毛儿盖河（为黑水河上游正源）四条主河流及溪沟99条。黑水河源于羊拱山脉希娘山东麓，全长162千米。小黑水河源于三姐妹山南麓，流长65千米，毛尔盖河源于夏沃隆山南麓，全长76千米。
黑水县属季风高原型气候，旱、雨季分明，日照充足，气温年差较小，日差较大，并随海拔高度不同差别较大，高山与河谷年均气温差值达20℃，县城芦花平均气温9℃，年极端最高气温33.5℃，极端最低气温-14.4℃。境内降雨分布不均，夏季集中，秋季阴雨连绵，年平均降雨量620.06毫米，无霜期平均166.1天。
黑水县土壤类型复杂，可分为12个土类、31个土种，主要有冲击土分布于河谷河滩及山谷沟口，山地褐色土分布于海拔2400~2900米半湿润中山区，灰褐土分布于海拔1900~2000米半干旱河谷地区，山地棕壤分布在海拔2900~4000米湿润高山地区，暗棕壤分布于3500~4000米湿润高山地区，山地灰化土分布于海拔3500~3800米原始森林地带，亚高山草甸土分布于海拔3500~4000米地带，高山草甸土分布于4000米以上高山地区。石灰岩土占全县土地总面积的8.4%。沼泽土、盐土、高山寒漠土分别分布于沼泽地、干旱河谷、高寒山顶。
黑水县受青藏高原气候影响，常有干旱、暴雨、冰雹、洪水、泥石流、霜冻等自然灾害发生。